'

"Ключевые методы молекулярной биологии. Фрагментный анализ"

Понравилась презентация – покажи это...





Слайд 0

"Ключевые методы молекулярной биологии. Фрагментный анализ" 1 Докладчик: Шадрин Д.М. е-mail: shdima@ib.komisc.ru


Слайд 1

Виды-двойники Fragaria orientalis Losinsk. - вид-двойник F. moschata. Отличается одной интересной особенностью: тычинки или пестики обычно отмирают, в результате чего цветок функционально однополый


Слайд 2

Актуальность: Успехи в развитии генетических исследований обусловлены наличием информативных генетических маркеров Развитие молекулярных методов исследований позволило создать новые тест-системы, позволившие анализировать генетический полиморфизм на уровне продуктов генов (белковый или биохимический полиморфизм) и на уровне генетического материала (полиморфизм ДНК).


Слайд 3

Задачи, решаемые с помощью методов ФА Для характеристики генетической гетерогенности (наличие в популяции разных аллелей генов) Для изучения уровня и структуры генетического разнообразия популяций (средняя гетерозиготность, число аллелей на локус, генетическое расстояние) Для идентификации сортов растений и пород животных Для оценки генеалогических связей Для поиска молекулярно-генетических маркеров, ассоциированных с желательными признаками


Слайд 4

Классификация


Слайд 5

Термины классической генетики Кодоминантный тип наследования маркера – когда метод анализа маркера позволяет выявить оба аллеля. Доминантный тип наследования маркера – когда метод анализа маркера позволяет выявить только один аллель. Аллели маркерных локусов – различные формы одного и того же маркера, расположенные в одинаковых участках (локусах) одних и тех же гомологичных хромосом.


Слайд 6

Классификация


Слайд 7

ПЦР – полимеразная цепная реакция


Слайд 8

ПЦР – полимеразная цепная реакция


Слайд 9

Детекция полиморфизма продуктов ПЦР


Слайд 10

Молекулярные маркеры, основанные на ПЦР RAPD – случайно амплифицированные полиморфные ДНК (Williams et al, 1990). ISSR – межмикросателлитные последовательности (Zietkiewicz et al, 1994). AFLP – полиморфизм длины амплифицированных фрагментов (Vos et al., 1995). SSAP – полиморфизм специфично амплифицированных последовательностей (Waugh et al., 1997). IRAP – полиморфизм амплифицированных последовательностей между ретротранспозонами (Kalendar, Shulman, 2006).


Слайд 11

RAPD – Random Amplified Polymorphic DNA ПЦР с использованием одного декануклеотидного праймера Схема RAPD анализа (Williams et al., 1990) RAPD analysis of somatic hybrid plants (sf1-sf3) M.sativa + M.falcata with the random primer RP7. (S. Arcioni et al.)


Слайд 12


Слайд 13


Слайд 14


Слайд 15


Слайд 16

ISSR – Inter Simple Sequence Repeat - ПЦР с использованием одного или нескольких праймеров длиной 15-24 н. Микросателлитная ДНК – ДНК из коротких тандемных повторов длиной от 1 до 6 пар оснований. Используются как молекулярные маркеры в определении родства, принадлежности к конкретной популяции, для исследования гибридизации. Микросателлиты характеризуются высокой скоростью изменения последовательностей, обусловленной «проскальзыванием» при репликации ДНК и точечными мутациями. Праймер: 5’ – CA CA CA CA CA CA CA CA CA G


Слайд 17

ISSR – Inter Simple Sequence Repeat - ПЦР с использованием одного или нескольких праймеров длиной 15-24 н. Схема ISSR анализа (Zietkiewicz et al., 1994; Gupta et al., 1994; Bornet, Branchard, 2001)


Слайд 18


Слайд 19


Слайд 20

AFLP – Amplified Fragment Length Polymorphism Схема одного из вариантов AFLP анализа (Zabeau, Vos, 1993) Сложный метод анализа, состоящий из нескольких этапов:


Слайд 21


Слайд 22


Слайд 23

Таким образом, в настоящее время молекулярные маркеры активно используются для решения различных вопросов, связанных с определением видовой принадлежности, выяснения степени родства различных групп организмов, их генетического полиморфизма и филогеографии, а также в практических целях для обнаружения того или иного полезного признака.


Слайд 24

СПАСИБО ЗА ВНИМАНИЕ!


Слайд 25

Филогеография объединяет филогению и пространственные паттерны. Иными словами, филогеография изучает пространственное распределение генеалогических групп. Различные взаимоотношения между генеалогией генов и географией стали обозначаться как филогеографический паттерн.


×

HTML:





Ссылка: