'

Повторяющиеся мобильные элементы

Понравилась презентация – покажи это...





Слайд 0

Повторяющиеся мобильные элементы Введение Открытие Бактериальные транспозоны P элементы LTR ретротранспозоны и ретровирусы SINE и LINE


Слайд 1

ДНК транспозоны / Ретротранспозоны Автономные / Не автономные Повторяющиеся Мобильные элементы


Слайд 2

Мобильные элементы: ДНК транспозоны Открытие Барбара Мак-Клинток Мозаичность початков кукурузы (Ac/Ds) Активатор (Ac) / Диссоциирующий элемент (Ds)


Слайд 3

Мобильные элементы: ДНК танспозоны Ac (Активатор) – автономный мобильный элемент, включающий ORF белка «транспозазы» который делает возможной транспозицию. Транспозаза «взаимодействует и с Ds элементами. Ds (Диссациатор) активность зависит от Ac: может перемещаться только когда Ac активен. Существует несколько типов Ds элементов.


Слайд 4

Мобильные элементы: ДНК танспозоны Как Ac и Ds приводят к мозаичности? Мутация – результат встраивания элемента в рамку считывания, вырезание элемента восстанавливает рамку считывания. Наличие одинаковых  Ac/Ds элементов может привести к некорректной рекомбинации по похожим последовательностям на разных хромосомах. Результат – хромосомные перестройки и аберрации.


Слайд 5

Схема взаимодействия Ds/Ac и образования различных фенотипов через включение/выключение аллелей.


Слайд 6

Мобильные элементы: ДНК танспозоны Бактериальные транспозоны Insertion Sequences (IS) – простые танспозоны Обратный повтор Транспозаза повтор повтор Обратный повтор


Слайд 7

Последствия встраивания IS элемента (Дупликация сайта встраивания) Мобильные элементы: ДНК танспозоны


Слайд 8

Консервативная / Репликативная транспозиция. Консервативная транспозиция – вырезание и встраивание элемента Репликативная транспозиция – копирование и встраивание Мобильные элементы: ДНК танспозоны


Слайд 9

Мобильные элементы: ДНК танспозоны P элемент дрозофила


Слайд 10

Гибридный дисгенезис


Слайд 11

Мобильные элементы: ретротанспозоны Жизненный цикл ретротранспозона ретротанспозон


Слайд 12

Мобильные элементы: ретротанспозоны Ретровирусы – жизненный цикл


Слайд 13

Мобильные элементы: ретротанспозоны Ретровирусы – структура вируса


Слайд 14

Мобильные элементы: ретротанспозоны Ретровирусы – структура ретроэлемента


Слайд 15

1. Автономные и не автономные элементы. 2. Длина 0,5-12 kb. 3. LTR (. Pol II промотор в LTR. 4. 3-6 рамок считывания. 5. Обратная транскрипция – в цитоплазме клетки, в вирусных компартментах. Мобильные элементы: Ретровирусы


Слайд 16

Мобильные элементы: автономные ретротанспозоны Ретротранспозоны (LTR)


Слайд 17

Мобильные элементы: Автономные ретротанспозоны Copia элементы 5-8.5 kb в длинну Long Terminal Repeats (LTR) как минимум 7 разновидностей, каждая по 10-100 копий в геноме Дрозофилы


Слайд 18

Мобильные элементы: Автономные ретротанспозоны Демонстрация ретропозиции (через РНК): Дрожжевая плазмида с активным Ty элементом в который встроен дополнительный интрон. Транспозиция возможна после вырезания интрона. Копия элемента интрона не имеет.


Слайд 19

Мобильные элементы: ретропозоны Основные ретропозоны в геноме млекопитающих: SINE и LINE SINE: Short Interspersed Element В геноме человека ~1 200 000 SINE LINE: Long Interspersed Element В геноме человека ~600 000 LINE


Слайд 20

1. Автономные элементы. 2. Длина 1-6 kb. 3. Внутренний pol II промотор. 4. Как правило 2 рамки считывания. Одна из них – эндонуклеаза/обратная транскриптаза. 5. Обратная транскрипция – в ядре клетки синхронно с интеграцией Мобильные элементы: LINE


Слайд 21

Обратная транскрипция использует ДНК в сайте встраивания как праймер. Мобильные элементы: LINE и SINE


Слайд 22

Жизненный цикл LINE на примере L1


Слайд 23

1. Не автономные элементы. 2. Длина 70-600 нуклеотидов. 3. Внутренний pol III промотор (A, B box). 4. «Компаньоны» LINE – используют жизненный цикл LINE для собственной ретропозиции. Мобильные элементы: SINE


Слайд 24

Мобильные элементы накапливаются в геномах. Они становятся структурными элементами. Какая часть генома состоит из мобильных элементов? - у нематод ~10% генома; - у рыб ~15% генома; - у курицы ~23% генома; - человека ~ 60% генома из них 57% - ретроэлементы. У высших растений до 90% генома может состоять из ретроэлементов. Накопление мобильных элементов в геномах


Слайд 25

Большинство мобильных элементов не активны. Только некоторые из них увеличивают количество своих копий. Со временем копии накапливают мутации и становятся разными. Накопление мобильных элементов в геномах


Слайд 26

Активные танс- и ретротранспозоны – мутагены и онкогены. Эндогенные ретровирусы могут вызывать заболевания. Повторяющиеся многократно элементы могут быть причиной хромосомных перестроек. «Древние», неактивные мобильные элементы являются структурными элементами. 5. В эволюционном аспекте мобильные элементы добавляют пластичности геному Роль мобильных элементов в геномах


×

HTML:





Ссылка: