'

Анализ микробиоты кишечника и экспресс-диагностика острых кишечных инфекций методом ПЦР

Понравилась презентация – покажи это...





Слайд 0

Анализ микробиоты кишечника и экспресс-диагностика острых кишечных инфекций методом ПЦР Суворова, Е.А. Тарасова, М.В. Куртуков, В.И. Людыно, А.Н. Суворов, ООО «НИЛ Диагностика», НИИЭМ СЗО РАМН, Военно-медицинская академия, Санкт-Петербург


Слайд 1

Из каких микробов состоит кишечная флора? Как определить ее состав? Зачем это делать? Три вопроса клинициста к микробиологу


Слайд 2

Наименование микроорганизмов Состав кишечной микрофлоры по ОСТ 91500.11.0004-2003


Слайд 3

Состав кишечной микрофлоры по ОСТ 91500.11.0004-2003


Слайд 4

Наиболее распространенные обитатели кишечника (Zoetendal E., 2006)


Слайд 5

Состав микрофлоры взрослого человека (Европа) Состав микрофлоры взрослого человека по ОСТ91500.11.0004-2003


Слайд 6

Бактериологический посев Микроскопия Дыхательный тест Генно- молекулярные методы PCR/denaturing electrophoretic polyacrylamide gels (PCR/DGGE, PCR/TTGE) Fluorescent in situ hybridization/fluorescence-activated cell sorting (FISH/FC) 16S rRNA филогения Метагеномика Мета транскриптомика ПЦР в режиме реального времени Методы определения микрофлоры кишечника


Слайд 7

Анализируемые показатели


Слайд 8

Преимущества и недостатки метода ПЦР в реальном времени: + эффективность в обнаружении анаэробных бактерий + быстрота выполнения (1-2 суток) + доступные условия транспортировки анализируемого материала до лаборатории (до двух дней в холодильнике) - невозможность подбора противомикробных препаратов


Слайд 9

Анализ микробиоценоза кишечника методом ПЦР в реальном времени - Bacteroides fragilis Этапы исследования: Выделение бактериальной ДНК Амплификация специфических участков бактериального генома и детекция флуоресцентного сигнала в реальном времени Расчет количественного соотношения бактерий по величине порогового цикла (абсолютное количество и отношение к общему бактериальному числу)


Слайд 10

Основные варианты дисбиотических нарушений, выявляемые методом ПЦР в реальном времени 1. значительное увеличение числа Bacteroides fragilis и соответственно изменение количественного соотношения Bacteroides fragilis/ Fecalibacterium prauznitzii. Норма Патология (язвенный колит) - Bacteroides fragilis (Сt=23) - Fecalibacterium prauznitzii (Сt=25) - Bacteroides fragilis (Сt=16) - Fecalibacterium prauznitzii (Сt=28)


Слайд 11

Выявление в диагностически значимых количествах (>10*4) представителей условно-патогенной флоры (Clostridium difficile, Clostridium perfringens, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumonia), в особенности штаммов, несущих гены патогенности Изменение соотношения субпопуляций анаэробных бактерий, осуществляющих различные виды брожения (например, продуцентов бутирата и продуцентов пропионата)


Слайд 12

Экспресс дифференциальная диагностика ОКИ Перечень возбудителей (всего 14) : -ротавирусы (типов А, В и С) -норовирусы (1 и 2 типа) -аденовирус (тип F) -астровирус -вирус гепатита А -парвовирус B19 -энтеровирусы -Shigella spp. -Salmonella spp. -Campylobacter spp. -энтероинвазивные Escherichia coli -Clostridium difificile (токсин А и токсин В) -Yersinia pseudotuberculosis -Yersinia enter?ocolitica


×

HTML:





Ссылка: