'

12 ДУПЛЕТНЫЙ КОД

Понравилась презентация – покажи это...





Слайд 0

12 ДУПЛЕТНЫЙ КОД Турнир юных биологов 2007


Слайд 1

Генетический код – это Способ записи информации о первичной структуре белков через последовательность нуклеотидов ДНК и РНК = «Словарь» перевода с языка нуклеиновых кислот на язык белков.


Слайд 2

Каким должен быть дуплетный код Число возможных дуплетов = 16 Им можно закодировать не более 15 а.к. один из дуплетов – на СТОП-кодон


Слайд 3

Наш метод создания кода: Выбрали белки лизоцим (129 а.к.) и миоглобин (154 а.к.); Разделили а.к. на две группы: а) обязательно кодируемые б) с похожими радикалами Посмотрели, какие а.к. наиболее часто встречаются в данных белках; Подобрали дуплеты и а.к. так, чтобы коэффициент q был как можно больше.


Слайд 4

Проблема глицина: считать глицин полярной или неполярной а.к.? Мы считали неполярной, потому что: Gly – п: qтр=1,16 Gly – н/п: qтр=1,28


Слайд 5


Слайд 6

Знаком начала гена мы выбрали СТАРТ-кодон АУ кодирует Мет, а в начале гена фМет. (в триплетном АУГ) Знак окончания гена – СТОП-кодон УА (в триплетном УАА, УАГ, УГА)


Слайд 7

Идеальный дуплетный код


Слайд 8

Свойства дуплетного кода: Отсутствие межкодонных знаков препинания Наличие межгенных знаков препинания Однозначность Неперекрываемость Дуплетность Нет вырожденности (избыточности) Экономичность (на белок той же длины нужно меньше ДНК)


Слайд 9

Сравним эти два кода – построенный нами дуплетный и стандартный триплетный Один из самых важных параметров - помехоустойчивость


Слайд 10

Помехоустойчивость X Y 1 2 Консервативная замена – не меняет класс аминокислоты Радикальная замена – меняет класс аминокислоты


Слайд 11

Гидрофобные (неполярные) Классификация аминокислот по полярности радикала Гидрофильные Полярные Заряженные (ионы) + -


Слайд 12

Подсчёт коэффициента помехоустойчивости (q). Число радикальных замен = 40, А консервативных - 44, Учитывая, что глицин – неполярная аминокислота и не включая кодон УА q = 44/40 = 1,1.


Слайд 13

Недостатки дуплетного кода: Таким кодом невозможно закодировать больше, чем 15 аминокислот. Возможный путь преодоления: Посттрансляционная модификация


Слайд 14

Molecular Cell Biology Harvey Lodish et al. Примеры пострансляционной модификации аминокислот


Слайд 15

Недостатки дуплетного кода: Коэффициент помехоустойчивости (q) меньше, чем у триплетного кода (qтр~1,28, а qдп?1,1) Нет вырожденности (избыточности).


Слайд 16

Литература В.А. Ратнер. Молекулярно-генетические системы управления. Наука, Новосибирск, 1981.


×

HTML:





Ссылка: