'

Гомологичные последовательности – последовательности, имеющие общее происхождение (общего предка). Признаки гомологичности белков сходная 3D-структура.

Понравилась презентация – покажи это...





Слайд 0


Слайд 1

Гомологичные последовательности – последовательности, имеющие общее происхождение (общего предка). Признаки гомологичности белков сходная 3D-структура в той или иной степени похожая аминокислотная последовательность разные другие соображения…


Слайд 2

Гомологи Ортологи Паралоги Ксенологи ? (W.M.Fitch, Syst.Zool.19,99(1970)


Слайд 3

Ортологи — последовательности, возникшие из одного общего предшественника в процессе видообразования. Ортологи, как правило, имеют одну и ту же функцию Паралоги — последовательности, возникшие из одного общего предшественника в результате дупликации одного гена в одном организме. Паралоги, как правило, имеют разные функции.


Слайд 4

Гэп – пропуск в последовательности Задача выравнивания = задача поиска сходства. Сходство — не то же, что гомология!


Слайд 5

«Идеальное» выравнивание – запись последовательностей одна под другой так, чтобы гомологичные фрагменты оказались друг под другом. домовой скупидом водомерка ? лесовоз ---лесо---воз ледоход лед---оход--- ? Гэп – пропуск в последовательности


Слайд 6

Схожие 3D структуры Вставка в «синей» последовательности


Слайд 7

Мутации, рекомбинация, …. ?


Слайд 8

Точечные мутации “Молчащая” Замена остатка Терминация ATA TGT ATA AAG GCA AAC TCC TGT TAA AC Ile Cys Ile Lys Ala Asn Ser Cys Stop x Сдвиг рамки


Слайд 9

Конверсия гена: “Non-reciprocal recombination“ Рекомбинация Кроссинговер: “Reciprocal recombination“ 2:2 3:1


Слайд 10

25 белков 9 белков 2 белка 12 белков 223 белка 243 белка 507 белков ЕС 2.5.1.15 ЕС 4.1.2.25 ЕС 2.7.6.3 Домены и многодоменные белки


Слайд 11

Домен – единица эволюции, структуры и функции белков. Домен – компактная, относительно независимо сворачивающаяся структура, относительно консервативная в процессе эволюции. Белок может состоять из одного или многих доменов.


Слайд 12

Бывает и такое…. (пример структурного выравнивания)


Слайд 13

AAAAAAAAAA AACDEAAAA Что лучше? AAAAAAAAAA AA---AAAAAAAA AACDE-AAAA AACDE----AAAA


×

HTML:





Ссылка: