'

А.Б. Рахманинова (13 апреля 2010 г.) Факультет Биоинженерии и Биоинформатики, 2 курс, весенний семестр Функции Мембранные белки. Транспортные белки.

Понравилась презентация – покажи это...





Слайд 0

А.Б. Рахманинова (13 апреля 2010 г.) Факультет Биоинженерии и Биоинформатики, 2 курс, весенний семестр Функции Мембранные белки. Транспортные белки.


Слайд 1

АТФ-синтетаза Ацетилхолиновый рецептор


Слайд 2

Объекты


Слайд 3

Объекты b-баррель a-спирали


Слайд 4

http://www.tcdb.org/index.php


Слайд 5

V.W.X.Y.Z


Слайд 6

В чем проблема? От 15% до 30% от общего числа белков — белки с хотя бы одной трансмембранной спиралью Всего ?59 705 белковых структур. Мембранных - 217 (0.36% ), 2009


Слайд 7

В чем проблема?


Слайд 8


Слайд 9

von Heijne “the positive-inside rule”


Слайд 10

http://opm.phar.umich.edu/


Слайд 11

Как оценить качество паттерна или профиля? Или как оценить качество предсказания?


Слайд 12

Ошибки…… Ошибки первого рода (FP): отвергается нулевая гипотеза, а она соответствует действительности. Ошибки второго рода (FN): принимается нулевая гипотеза, а она не верна. Ошибки третьего рода: справедливо отвергнута нулевая гипотеза на основе неверных соображений.


Слайд 13

Сравнение нескольких предсказаний ROC-кривые (Receiver operating characteristic) или кривые ошибок


×

HTML:





Ссылка: