'

Tough Protein Enhancer

Понравилась презентация – покажи это...





Слайд 0

1 Научный руководитель: Галинский Виталий Александрович, Преподаватель информатики и программирования ФМЛ № 30 Tough Protein Enhancer Косуха Анатолий 10-1 класс Логачев Федор 10-3 класс


Слайд 1

Составные части проекта Загрузка данных из файла формата “Protein Data Bank” Обработка информации Реализация докинга Визуализация, оконная система


Слайд 2

Общий ход работы


Слайд 3

Формат хранения протеинов Формат “Protein Data Bank” : Достоинства: - Существование больших баз протеинов - Большое распространение Недостатки: - Большой объем памяти компьютера - Отсутствие некоторых данных - Наличие множества версий формата Формат “TPE”: - Отсутствие недостатков формата “PDB”


Слайд 4

Формат хранения протеинов


Слайд 5

Реализация докинга Первый этап – случайное расположение молекулы лиганда(таблетки) на поверхности биомишени(протеина). Второй этап – расчет потенциальной энергии взаимодействия комплекса. Цель – минимизировать энергию взаимодействия.


Слайд 6

Расчет энергии взаимодействия Энергия электростатического взаимодействия Энергия Ван-дер-Ваальса Лиганд Биомишень


Слайд 7

Генетический алгоритм Размер ячейки Вершина решетки Пробный атом Сложность алгоритма:


Слайд 8

Визуализация Система вывода Система примитивов Система освещения Текстурный менеджер Система вывода прозрачных объектов Низкий уровень Оконная система Высокий уровень – взаимодействие с пользователем


Слайд 9

Визуализация Примеры примитивов


Слайд 10

Визуализация Оконная система


Слайд 11

Выводы и перспективы Реализован оригинальный формат, который обладает значительными преимуществами по сравнению с PDB Реализована система визуализации протеинов Реализована быстродействующая система докинга Перспективы: Выводы: Оптимальный алгоритм докинга на базе генетических алгоритмов Учет других видов энергии взаимодействия молекул Улучшение системы визуализации


×

HTML:





Ссылка: