'

Эволюция геномов

Понравилась презентация – покажи это...





Слайд 0

Эволюция геномов М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс


Слайд 1

Статус гена в геноме PPI – количесто белок-белковых взаимодействий EL – уровень экспрессии KE – летальность нокаутов ER – скорость эволюции PGL – вероятность потери в геноме NP – количество паралогов GI – количество геномных взимодействий


Слайд 2

Гены и геномы - деревья Дерево генов может не совпадать с деревом видов Дупликации Делеции Горизонтальные переносы


Слайд 3

Задача согласования деревьев «вложение» дерева видов в дерево генов с минимальным числом дупликаций и делеций (минимальное) количество дупликаций и делеций связано (чем раньше дупликации и чем их больше, тем больше делеций), так что можно минимизировать одновременно … и горизонтальных переносов Проблема: как взвешивать события? Всегда можно обойтись минимальным числом дупликаций и очень многими делециями без переносов И наоборот – одними переносами


Слайд 4

Альтернативные подходы к идентификации горизонтальных переносов Не тот ближайший родственник (митохондрии, термотога, аквифекс) Гены, которые слишком близко друг к другу (много ближе, чем полагается для данной пары геномов) Ср. контроль ортологичности Упражнение: как будут выглядеть дерево и график, если геном Х известен и есть еще более далекий Z?


Слайд 5

примеры По горизонтали – расстояние между геномами По вертикали – расстояние между генами


Слайд 6

Геномные перестановки


Слайд 7

Полногеномные дупликации


Слайд 8

Дрожжи


Слайд 9


Слайд 10

Можно обойтись без пар


Слайд 11

Влияние внутри-геномных перестановок после дупликации: хромосомная мозаика


Слайд 12

Геномы и виды Хромосомная нестабильность У человека и шимпанзе разное число хромосом Слепушонки Симбиогенез Митохондрии и хлоропласты. Нуклеоморф Buchnera и т.п. Вольбахия; осы Цихлиды и трехиглые колюшки


Слайд 13

Виды и далее Нематоды, дрозофилы и млекопитающие (не)Монофилетические таксоны. Птицы как класс рептилий.


Слайд 14

О происхождении жизни Археи и бактерии: Независимое происхождение мембран (разные вещества, негомологичные пути синтеза) Существенно разная репликация ДНК Похожие компоненты трансляции и транскрипции Как общие, так и специфические метаболические пути


Слайд 15


Слайд 16


×

HTML:





Ссылка: