'

Гомологичные последовательности – последовательности, имеющие общее происхождение (общего предка). Признаки гомологичности белков сходная 3D-структура.

Понравилась презентация – покажи это...





Слайд 0


Слайд 1

Гомологичные последовательности – последовательности, имеющие общее происхождение (общего предка). Признаки гомологичности белков сходная 3D-структура в той или иной степени похожая аминокислотная последовательность разные другие соображения…


Слайд 2

Гомологи Ортологи Паралоги Ксенологи ? (W.M.Fitch, Syst.Zool.19,99(1970)


Слайд 3

Ортологи - последовательности, возникшие из одного общего предшественника в процессе видообразования. Ортологи, как правило, имеют одну и ту же функцию Паралоги - последовательности, возникшие из одного общего предшественника в результате дупликации одного гена в одном организме. Паралоги, как правило, имеют разные функции.


Слайд 4

«Идеальное» выравнивание – запись последовательностей одна под другой так, чтобы гомологичные фрагменты оказались друг под другом. Дом Скупидом Водомерка ? Домов---ой Домов-----ой Домо-строй Домо-строй Задача выравнивания = задача поиска сходства. Сходство ? гомология ? Гэп – пропуск в последовательности


Слайд 5

Гэп – пропуск в последовательности Как получить «оптимальное» выравнивание? Один из способов:


Слайд 6

Мутации, рекомбинация, …. ?


Слайд 7

Example: point mutations Silent mutation Amino acid change Termination x Frame shift


Слайд 8


Слайд 9

Domain insertion: “Mosaic proteins” Structural modules: plasminogen kringle domain EGF domain fibronectin finger domain vit. K-dependent calcium-binding domain (osteocalcin) tissue plasminogen activator urokinase prothrombin plasminogen Domain origins: trypsin-like serine protease Mosaic proteins fibronectin epidermal growth factor (EGF)


Слайд 10

Домен – единица эволюции, структуры и функции белков. Домен – компактная, относительно независимо сворачивающаяся структура, относительно консервативная в процессе эволюции. Белки могут состоять из одного или многих доменов.


Слайд 11

Бывает и такое…. (пример структурного выравнивания)


Слайд 12

AAAAAAAAAA AACDEAAAA Что лучше? AAAAAAAAAA AA---AAAAAAAA AACDE-AAAA AACDE----AAAA


×

HTML:





Ссылка: