'

Моделирование Нелинейной Взаимосвязи Между Генами на Основе Функции «Копула»

Понравилась презентация – покажи это...





Слайд 0

Моделирование Нелинейной Взаимосвязи Между Генами на Основе Функции «Копула» Григорьев Д. НИУ ВШЭ, кафедра фондового рынка и рынка инвестиций Кескинбаев А. НИУ ВШЭ, институт развития образования. Львов Н. НИУ РГУ Нефти и Газа им. И.М. Губкина Никитин А. ФГУП ГНЦ РФ ИТЭФ, лаборатория атомно-масштабных исследований Пеникас Г. НИУ ВШЭ, кафедра математической экономики и эконометрики  


Слайд 1

Развитие геномных проектов Число проектов по секвенированию генома, 1995-2010 по данным GOLD www.genomesonline.org


Слайд 2

Генные сети Генная сеть - группа координированно работающих и взаимодействующих между собой генов, контролирующих формирование фенотипических признаков организмов на основе информации, закодированной в геномах Основные задачи в рамках работы с генными сетями


Слайд 3

Математическое моделирование генных сетей


Слайд 4

Линейные модели Уровень активности гена в определенный момент времени t, определяется суммой активностей остальных генов в предыдущий момент времени, взятых с весами в соответствии со степенью их влияния на интересующий ген Основное препятствие: колоссальный рост числа необходимых для описания сети уравнений с ростом числа генов. Число состояний в которых находятся гены будет пропорционально возрастать как с увеличением числа самих генов, так и с увеличением среднего числа взаимодействий приходящихся на один ген


Слайд 5

Баесовские сети Байесовские сети - графические структуры для представления вероятностных отношений между большим количеством переменных и для осуществления вероятностного вывода на основе этих переменных. Применимость: декомпозируемость систем, знание свойств элементов и связей между ними Параметры влияющие на эффективность метода Chen X et al. Bioinformatics 2006;22:1367-1374 Генная сеть, отвечающая за жизненный цикл клетки дрожжей, апостроенная на основе БС


Слайд 6

Копула. Понятие и применение R – многомерная случайная величина F – значение ее функции распределения в Многомерная теорема Шкляра утверждает, что существует С: Тогда функция С будет называться копулой и будет определяется как где и - частные CDF


Слайд 7

Копула. Понятие и применение Копула – вероятностная функция нескольких переменных, позволяющая связать частные одномерные распределения в одно совместное многомерное. Частные распределения - гауссовские Копула - гауссовская Совместное распределение - гауссовское +


Слайд 8

Преимущества использования копул при моделировании генных сетей


Слайд 9

Перспективы


Слайд 10

Благодарю за внимание!


×

HTML:





Ссылка: